天明8年（1788年），京都禁裏（御所）在大火中烧失，尾张德川家作为德川御三家之一，在禁裏重建相关政治工作中迅速接近朝廷。不仅如此，它还掌握了将军家斉所在的一桥德川家的不利弱点，企图逼迫家斉退位以夺取将军之位。松平定信（大宮敏）察觉到尾张藩的不轨动向，为阻止其阴谋、守护家斉的地位，便带着家臣踏上京坂巡视之旅。然而，途中尾张藩派出以百々地源九郎（勝木敏之）为首的忍者集团——伊贺十忍，他们奉密令暗杀定信，早已埋伏在道路旁伺机而动。秋草与从伊贺同心中挑选出的雾之遁兵衛（牧冬吉）等9名忍者一同，一边负责定信的护卫工作，一边以东海道为战场，与伊贺十忍展开战斗。

黒潮党盯上了持有村上水軍留下的秘宝线索的お静。老中・松平定信命令遁兵衛和真之介去保护她，由此，他们的战斗拉开了帷幕。

德川二代将军秀忠时代，家康之孙松平信太郎在禅寺中长大，过着与政治无关的生活。一日，信太郎救下一名遭忍者集团袭击而受伤的忍者，此人名叫贺夜猿，是伊贺的逃忍。机缘巧合下，信太郎接到大御所家康的命令。原来，家康忧虑支持秀忠的本多上野介掌控政治实权，利用伊贺忍者推行残酷政策。为回应家康“代替自己惩处天下恶行、纠正政治错误”的愿望，信太郎为了正义踏上旅程。 主人公隐秘剑士松平信太郎由荻岛真一饰演，这部作品将时代剧与青春剧氛围相融合。配角方面，曾在前作中饰演雾之遁兵卫的牧冬吉扮演信太郎的搭档贺夜猿，而在前作中就出演反派的天津敏，此次饰演率领赤目十人群的宿敌赤目幻幽斉，延续了系列风格。

松平定信（加賀邦男）的江户屋敷来了自称来自甲贺的幻之谷的“幻之众”七名甲贺忍者。幻之众称是受定信邀请而来，但定信并无印象。负责定信身边警卫的伊贺忍者被幻之众当作试手，轻易打倒，幻之众离开定信屋敷后，甲贺五十三家笔头忍者·甲贺的金刚（天津敏）出现，告知幻之众是被黑暗御大老招来的。对定信怀有个人怨恨的黑暗御大老，命令金刚和幻之众暗杀定信的心腹奉行们、幕府御用豪商，以及秋草和雾之遁兵卫等总计二十一人，目的是孤立定信使其失势。目付役笔头遭幻之众暗杀的现场被秋草撞见，秋草与遁兵卫、伊贺同心三之组的忍者们合作，为阻止暗杀计划，以江户为舞台与甲贺的金刚和幻之众展开对决。 这部第八部使用了东映京都摄影所……

德川御三家之一的纪州德川家，其江户家老内藤大学（武藤英司）指使根来忍者头领牙竜道士（吉田義夫），通过祈祷咒杀了卧病在床的藩主纪伊中纳言。内藤企图拥立纪伊中纳言年幼的次男吉纲为新藩主，为实施自己成为吉纲监护人并掌控纪州藩的计划，他命令牙竜道士暗杀作为世继对立候补的长男纪伊頼方（添田武利）。察觉到这一阴谋的纪州藩国家老织部飛騨守（青野平義），命令手下纪州流忍者纪州组的7人护卫頼方。牙竜道士打算利用内藤让吉纲成为藩主后，暗杀家斉并让吉纲成为将军，从而在暗中操纵天下。秋草受松平定信秘密委托，与雾之遁兵衛一同参与到纪州家的继承人争夺风波中，站在了织部飛騨守和纪州组这边。遁兵衛的师傅、居住在伊贺之里的上忍名張半太夫（小林重四...

以甲贺白云斉（小林重四郎）为首的甲贺忍者集团，其忍者・いざないの夢助不断对江户的商家进行袭击。这背后是尾张德川家的阴谋，他们企图借此恶化治安，让将军家斉失势。两年前，受松平定信命令潜入尾张藩后便行踪不明的伊贺同心・大月五郎太，在身负濒死重伤的情况下，于归途中知晓了闇法師的存在。曾在第三部登场、被秋草改造了右腕的“伊贺十忍”成员水口幻斉，此次作为闇法師的帮手再度现身。而暗中操控闇法師和尾张藩的幕后黑手・闇の御隠居，向对幕府政策持批判态度的全国谱代大名发出号召，让他们在赞同尾张德川家的连判状上署名，打算在全国大名齐聚的日光东照宫举行的德川家康大法要上，以连判状为依仗，迫使家斉将军退位……

松平定信（美川洋一郎）得知在幕府直辖的天领甲州山中，有武田信玄留下的隐密金山，且有人私自开采。他派遣密探田辺孫太夫（高松政雄）前去调查。田辺完成调查，即将返回向定信复命时，被甲贺忍者名張左伝（高木二朗）杀害，这一幕被秋草目击。松平定信委托秋草寻找隐密金山的管理者和幕后黑手。在此过程中，秋草遇到了少年馬場周作（大森俊介），周作遵照失踪父亲的嘱咐，从甲州深山来到西念寺拜访呑海和尚后前往江户。原来，受尾張徳川家指使，甲贺忍者为筹措颠覆幕府的军资，绑架了周作的父亲和甲州百姓，强迫他们在隐密金山从事采矿工作。秋草和周作前往甲武信ヶ岳，然而在甲州街道上，以甲賀竜四郎（友田輝）为首的忍者集团甲贺十三人众早已设下埋伏等待着他们。

三旺脾气暴躁，弟媳杜鹃仗义相助，引发家庭矛盾。春丽内心苦闷，与旧识建业相遇谈心，却被丈夫误会，导致意外落水。谢老汉心力交瘁，最终召集全家商议家事。分家现场，春丽获得应有补偿，老汉道出多年积蓄，这个传统大家庭面临新的选择。故事展现农村家庭的情感维系与观念碰撞，交织着夫妻矛盾、代际沟通等现实议题。

恶棍本特居然没死，他和爱什顿一起去找梅因一家报仇。爱什顿对梅因的庄园垂涎已久，本特趁奥里毫无防备时将其刺死。玛德琳并不知道是谁杀死了奥里。爱什顿没料到本特会杀害哥哥，于是把本特推进河里后逃离现场，后来沦为了妓女。查尔斯遇见了女演员维拉，两人相爱了。但他不得不前往西部与印第安人打交道。奥里的哥哥库伯想尽办法想要得到玛德琳的土地。本特没死，又去找乔治寻仇，还杀死了康斯坦斯，之后绑架了查尔斯的儿子。乔治决心除掉本特，找到查尔斯后两人联手将本特杀死。阿什顿结识了一名嫖客并和他结了婚。二人回到查尔斯顿找库伯收购玛德琳的庄园，没想到买到的旧庄园早已变成一片废墟。库伯联合三K党准备偷袭玛德琳的庄园，好在库伯的妻子提前通知了玛德琳。乔治在玛德琳受袭被抓时及时赶回，将她救了出来。两人一起规划未来的生活。

姬发联合四方诸侯进军朝歌。殷寿与通天教主大摆“九曲黄河阵”和“诛仙阵”。元始天尊携十二金仙下山，人仙妖三界大战一触即发……